염색체를 매핑하는 자동화 된 핵형 분석 소프트웨어

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Karyotyping은 개체의 전체 염색체 '지도'를 완전히 이해할 수 있도록하기 위해 유기체에서 발견되는 모든 염색체를 순서화하고 페어링하는 과정입니다.

하지만 먼저 염색체가 무엇인지 이해해야합니다. 염색체는 각 신체 세포의 핵 내에 포함 된 실과 비슷한 구조입니다.

각 염색체 구조는 신체의 전체 유전 정보 계획을 포함합니다. 이것은 당신의 몸이 구조화되고, 자극에 반응하고, 질병에 걸리기 쉬운 경향을 지시합니다. 여성은 2 개의 'X'염색체를 가지고 있으며, 남성은 'X'와 1 개의 'Y'염색체를 가지고 있습니다. 당신 몸의 각 세포는 총 23 개의 염색체 쌍과 46 개의 염색체를 가지고 있습니다.

연구자가 각 환자의 염색체 염기 서열을 이해할 수 있도록 염색 소프트웨어 를 사용 합니다 . 이 유형의 소프트웨어는 염색체 분석을 수행하도록 설계되었으며 사람의 염색체 구조와 수를 평가합니다. 이렇게함으로써 연구원과 과학자들은 이상을 발견 할 수 있습니다.

이 기사에서는 핵형 분석을 수행 할 수있는 훌륭한 소프트웨어 옵션을 살펴 보겠습니다.

2019 년에 사용할 수있는 상위 5 개 자동화 핵형 검사 도구

1

ArgusSoft

ArgusSoft는 밴드 위치에 따라 사람의 염색체를 자동으로 핵형 변환 할 수있는 훌륭한 소프트웨어 옵션이며 동물과 식물의 염색체를 온라인으로 핵형 타이핑하는 데에도 사용할 수 있습니다.

주요 특징들:

  • G, Q, R 염색
  • 굴곡 인식을 통한 인간 염색체의 자동화 된 핵형 분석
  • 돼지 염색체의 자동화 된 핵형 분석
  • 다양한 클린 넌스 레벨 - 400, 550 및 850 레벨을 갖는 인간 염색체의 표준 표의 3 가지 기본 내장
  • 다른 동물 및 식물 종에 표준 염색체 표의 그램의 기초를 추가 할 수 있습니다.
  • 샘플 준비 방법
  • 카메라와 스캐너를 사용한 중기 판 이미지의 입력
  • 그래픽 이미지 첨부
  • 응용 및 접촉 염색체의 자동 분류
  • 염색체와 표의 문자 비교

또한 ArgusSoft를 사용하여 미리 설정된 준비를 사용하여 염색체 인식 시스템을 교육하고, 내장 데이터베이스에서 중기 플레이트 이미지 및 karyogram을 전송하고, 보고서 패턴을 생성하고, 올바른 karyogram을 생성하고 이미지 및 분석 결과를 저장 및 인쇄 할 수 있습니다.

공식 웹 사이트에서 ArgusSoft를 사용하기위한 교육 및 지원을받을 수 있습니다. 지원 센터에는 교육, 유지 보수 및 컨설팅 서비스가 포함됩니다.

ArgusSoft 사용해보기

2

응용 된 스펙트럼 이미징에 의한 HiBand

HiBand는 Applied Spectral Imaging이 만든 소프트웨어로 디지털 핵형 타이핑 기능을 사용하여 고급 염색체 분석을 수행 할 수 있습니다. 이 소프트웨어

자동 스캔 기능을 사용하여 염색체 구조에 대한 심층 분석을 수행합니다.

HiBand에있는 다양한 기능을 사용하여 결과 데이터의 색인, 계산, 저장 및 관리를 할 수 있습니다. 이 강력한 소프트웨어를 사용하여 염색체 서열을 자동으로 스캔 할 수도 있습니다.

Karyotyping 기능을 사용하여 얻은 결과는 암호로 보호되고 암호화 된 레이어가있는 안전한 위치에 저장할 수 있습니다. 따라서 중요한 시퀀싱 데이터를 잃어 버릴 염려가 없기 때문에 실험실의 효율성이 향상됩니다.

결과를 정렬하는 것은 매우 쉬운 방법으로 수행됩니다. 특정 염색체 시퀀스를 검색하면 모든 결과가 포함 된 화면에 표시되어 쉽게 수정할 수 있고 검토 할 수 있으며 모든 태그에 태그를 추가 할 수 있습니다. 파일의

주요 특징들:

  • Brightfield Karyotyping-G-Band 및 R-Band
  • 형광 Karyotyping-Q-Band, R-Band 및 FISH
  • 스펙트럼 핵형 분석
  • 자동 염색체 계수
  • 염색체 색인 생성 및 분류
  • 고급 염색체 분리 및 향상된 이미지 향상
  • 이미지 갤러리 - 모든 화면 중기와 핵형을 한 화면에 나타낼 수 있습니다.
  • 염색체를 비교할 수 있습니다 - 나란히 볼 수 있습니다.
  • Abberant Ideogram - 이미지 생성기에서 염색체, 세포, 표의 문자 및 주석을 추가 할 수 있습니다.

HiBand는 실험실 효율성을 높이기 위해 완전 자동화 된 워크 플로우를 사용하고, '시작 및 종료'검색 기능을 제공하고, 중기를 찾고, 바코드를 자동으로 읽고, 슬라이드 스캔 중에 실시간으로 이미지를 업로드하고 실험실 LIS Central Portal로 내보내고 데이터 베이스.

HiBand 사용해보기

MetaSystems의 Ikaros

이 핵형 분석 시스템은 한 화면에 모든 기능을 제공하는 매우 직관적 인 사용자 인터페이스를 가지고 있습니다. 이렇게하면 얻은 모든 정보에 쉽고 빠르게 액세스 할 수 있습니다.

Ikaros는 이미지 데이터 및 사례 구성을 지원하도록 설계된 플랫폼 인 Neon과 함께 사용할 수 있습니다. Neon은 모든 이미징 작업, 외부 소스에서 데이터를 수집하고 사례 관리 대시 보드를 사용하여 이해하기 쉬운 방식으로 제시 할 수 있습니다.

이 도구를 사용하면 중요한 정보를 가까이에서 안전하게 보관할 수 있지만 매우 강력한 데이터 관리 알고리즘을 사용하고 데이터를 관찰 할 수있는 다양한 방법을 제공하며 키워드 및 데이터 특성을 기반으로 특정 검색을 제공 할 수 있습니다.

Neon과 그 기능에 대한 자세한 내용은 여기를 확인하십시오 .

Ikaros는 Brightfield G-Band 및 R-Band, Fluorescence Q-Band, R-Band 및 FISH와 같은 다양한 밴딩 기술을 지원하여 사람, 식물 및 동물에 대한 많은 미리 정의 된 Karyogram 형식을 제공합니다. 이 양식을 쉽게 편집하여 수행중인 연구 유형에 필요한 모든 데이터를 추가 할 수 있습니다.

당신이 클래스 또는 karyograms에 의해 염색체를 비교할 수 있다는 사실은 당신이 쉽게 차이를 식별 할 수있는 훌륭한 정보를 제공합니다.

시도 Ikaros

4

Microptic의 MetaClass

MetaClass는 모듈 방식으로 설계된 훌륭한 karyotyoping 소프트웨어입니다. 이 소프트웨어는 염색체의 핵형 분석 및 FISH 연구를 수행하는 데 도움을줍니다.

MetaClass는 다음 모듈로 구성됩니다.

  • MetaClass 데이터베이스

MetaClass의 모듈 중 하나와 함께 설치할 수있는 데이터베이스. 환자 세부 정보를 저장하고 결과에 쉽게 액세스 할 수 있습니다. 이 모듈을 사용하여 모든 언어로 사용자 정의 보고서를 작성할 수 있습니다.

  • MetaClass Karyotyping

중기 준비 단계의 이미지를 디지털 방식으로 캡처 한 후 핵 염색체를 연구하고 크기, 위치 등을 기준으로 쌍으로 배열 할 수 있습니다.이 모듈은 염색체 밴드와 관련하여 우수한 품질의 결과를 제공하며, 전문적인 보고서를 제공하십시오.

주요 기능은 다음과 같습니다.

  • 핵형의 연구는 brightfield 100X 배율에서 분석됩니다
  • 여러 가지 Metaphase 이미지 캡처 가능
  • 생생한 결과를 위해 이미지 품질을 수정할 수 있습니다.
  • 염색체의 자동 분류
  • 4 화면보기 - 중기, 핵형 및 분류되지 않은 염색체 창
  • 염색체 프로토 타입을 표시 할 수 있습니다.
  • 분류되지 않은 염색체는 중첩, 분리, 교차, 회전 등 자동 또는 수동으로 수정할 수 있습니다.
  • MTC 세션 파일 또는 BMP 이미지는 언제든지 저장하고 다시로드 할 수 있습니다.
  • 주석과 주석을 추가 할 수있는 개별 염색체를 Metaclass Database로 내보낼 수 있습니다.

다음은 Metaclass 핵형 분석 보고서의 예입니다.

  • MetaClass FISH

이것은 Fluorescent In SITU Hybridization (FISH) 이미지를 얻을 수있게 해주는 분석 모듈입니다. 이 모듈은 형광 DNA 프로브를 사용하여 이미지를 포착하고 유전 적 이상 (trisomies, mocrodelections, chromosome rearrangements 등)을 확인할 수있게합니다.

FISH 이미지는 100X 배율로 분석되며 이미지 선명도의 범위가 넓기 때문에 다양한 필터로 이미지를 캡처 할 수도 있습니다.

위에 제시된 모듈 및 기타 기능에 대한 자세한 내용을 보려면 MetaClass 카탈로그를 살펴보십시오.

흥미로운 유형이고 FISH 방법을 사용하여 얻은 보고서를보고 싶다면 다음과 같이 할 수 있습니다.

샘플 PDF 파일.

MetaClass 사용해보기

5

GenASis Bandview

GenASis Bandview는 다른 capabitilites를 가진 모듈로 만들어진 또 다른 훌륭한 karyotyping 소프트웨어입니다. 이 앱을 사용하면 핵형 동화 진단을 수행하고 정확한 테스트 결과를 얻을 수 있습니다.

이 소프트웨어를 사용하면 회사의 요구 사항 및 달성하고자하는 목표에 따라 워크 플로우 및 진단 프로세스를 완벽하게 사용자 정의 할 수 있습니다.

BandView에서 제공되는 다양한 도구는 마우스 클릭 한 번으로 쉽게 접근 할 수 있으며 강력한 G / R / C / Q-band 핵형 타이핑 경험을 제공합니다. 중기를 찾고 이미지를 캡처 할 때 자동 또는 수동 워크 플로 중에서 선택할 수 있습니다.

염색체 이상이 발견되면 환자의 유전 물질의 추가, 삭제 또는 재배치를 통해 관찰 할 수 있습니다. BandView로 FISH 분자 기술의 밴드를 사용할 수 있습니다.

FISH는 flourescent probe를 사용하여 염색체의 다른 부분에 부착하여 소프트웨어가 특정 DNA 염기 서열에서 발견되는 비정상적인 염색체를 검출하고 위치를 확인하도록합니다.

GenASis Bandview 사용해보기

결론

이 기사에서는 2018 년 말에 시장에 출시 된 최고의 자동화 된 핵형 분석 소프트웨어에 대해 살펴 보았습니다.

이 기사에서 다루는 핵형 분석 소프트웨어 옵션은 회사의 목표를 달성하는 데 도움이되는 다양한 기능을 제공합니다.

이러한 유형의 소프트웨어를 사용하면 수천 개의 염색체 구조를 신속하게 계산하고, 다양한 전문 기술로 분석하고, 이상 징후를 쉽게 식별 할 수있는 고급 보고서를 작성할 수 있습니다.

우리는이 상위 5 개 목록에서 제시 한 소프트웨어에 대한 귀하의 의견을 알고 싶습니다. 아래의 의견란을 사용하여 알려주십시오.

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